Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Grik3B1AS29 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms