Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ubl3Q9Z2M6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms