Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Skp2Q9Z0Z3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms