Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Nek3Q9R0A5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms