Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col4a4Q9QZR9 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 400.3 ms