Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pkd2l2Q9JLG4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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