Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tlr5Q9JLF7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tlr5Q9JLF7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tlr5Q9JLF7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tlr5Q9JLF7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tlr5Q9JLF7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms