Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gfra4Q9JJT2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms