Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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OtofQ9ESF1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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OtofQ9ESF1 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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