Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn2Q9ER65 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms