Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rhox9Q9EQM5 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rhox9Q9EQM5 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms