Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Med27Q9DB40 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Med27Q9DB40 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms