Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cnot8Q9D8X5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cnot8Q9D8X5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Cnot8Q9D8X5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnot8Q9D8X5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot8Q9D8X5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot8Q9D8X5 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot8Q9D8X5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot8Q9D8X5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot8Q9D8X5 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot8Q9D8X5 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot8Q9D8X5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot8Q9D8X5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot8Q9D8X5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms