Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Rep15Q9D7T1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Rep15Q9D7T1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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