Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms