Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tubgcp4Q9D4F8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Tubgcp4Q9D4F8 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tubgcp4Q9D4F8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tubgcp4Q9D4F8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tubgcp4Q9D4F8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tubgcp4Q9D4F8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tubgcp4Q9D4F8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tubgcp4Q9D4F8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tubgcp4Q9D4F8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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