Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Pramef12Q9D2F1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Pramef12Q9D2F1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Pramef12Q9D2F1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Pramef12Q9D2F1 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms