Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SdhdQ9CXV1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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