Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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