Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms