Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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