Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atg3Q9CPX6 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms