Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Smim3Q99PE5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Smim3Q99PE5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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