Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup155Q99P88 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup155Q99P88 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms