Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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GatbQ99JT1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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GatbQ99JT1 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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GatbQ99JT1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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GatbQ99JT1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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GatbQ99JT1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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GatbQ99JT1 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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GatbQ99JT1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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GatbQ99JT1 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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GatbQ99JT1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
GatbQ99JT1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
GatbQ99JT1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms