Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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