Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp934-201ENSMUST00000082203 993 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r201-201ENSMUST00000091730 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6710-201ENSMUST00000109011 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms