Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms