Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Krt79Q8VED5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Krt79Q8VED5 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Krt79Q8VED5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Krt79Q8VED5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Krt79Q8VED5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Krt79Q8VED5 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms