Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sgms1Q8VCQ6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sgms1Q8VCQ6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Sgms1Q8VCQ6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sgms1Q8VCQ6 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sgms1Q8VCQ6 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sgms1Q8VCQ6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sgms1Q8VCQ6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sgms1Q8VCQ6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms