Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxc12Q8K5B8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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