Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
OptnQ8K3K8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OptnQ8K3K8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms