Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ncapd2Q8K2Z4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms