Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rasgef1bQ8JZL7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rasgef1bQ8JZL7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rasgef1bQ8JZL7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Rasgef1bQ8JZL7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Rasgef1bQ8JZL7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms