Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE6

Slc38a2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a2Q8CFE6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Slc38a2Q8CFE6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms