Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
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