Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms