Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Gm9955Q8CEJ8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tln2-201ENSMUST00000039662 8052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Gm9955Q8CEJ8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms