Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ccdc73Q8CDM4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms