Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nhlrc3Q8CCH2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nhlrc3Q8CCH2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms