Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc2Q8BKV1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms