Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NanogQ80Z64 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1912.6 ms