Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ttc28Q80XJ3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ttc28Q80XJ3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc28Q80XJ3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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