Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms