Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ube2q1Q7TSS2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2q1Q7TSS2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms