Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Trappc6aQ78XR0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc6aQ78XR0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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