Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih3Q6ZWS4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih3Q6ZWS4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih3Q6ZWS4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih3Q6ZWS4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih3Q6ZWS4 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Cnih3Q6ZWS4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnih3Q6ZWS4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cnih3Q6ZWS4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms