Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc88cQ6VGS5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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