Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chd4Q6PDQ2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chd4Q6PDQ2 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms