Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trak1Q6PD31 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms